250 років тому 26 вересня 1763 року в Житомирі утворено францисканський чернечий дім. Спочатку під опікою Св. Йоанна з Дуклі був побудований монастир та дерев’яний храм, який у 1820 р. згорів.

Упродовж ХІХ-ХХ cт. приміщення храму використовувалося як кінотеатр, бібліотека, будинок народної творчості тощо. У 1997 році екселенція Ян Пурвінський освятив храм, а в 2006 році францисканцям були повернуті колишні монастирські приміщення, зайняті у радянський час обласним військкоматом.

29 вересня 2013 року, у Семінарійському костьолі Святого Йоанна з Дуклі відбулися урочистості та святкові богослужіння з нагоди 250-річчя храму.

На відзначення ювілейної дати до храму завітали священнослужителі Архієпископ Мечислав Мокшицький, Римо-католицький архієпископ, ватиканський дипломат, Апостольський Нунцій в Україні Томас Едвард Ґалліксон, Архієпископт Київсько-Житомирської дієцезії Петро Мальчук, Єпископ-ординарій Києво-житомирської дієцезії Римо-Католицької Церкви Ян Пурвінський, Єпископ-помічник Віталий Скомаровский, міністр Ордену Братів Менших в Україні отець Доброслав Копистеринський, Архиєпископ Житомирський і Овруцький Ізяслав.

Відвідали святкові богослужіння також Житомирський міський голова Володимир Дебой, заступник голови ОДА Ярослав Долгих, секретар міської ради Любов Цимбалюк, депутати міської ради Неля Ковалюк, Олег Горай, Володимир Михалець, Микола Савенко, член виконавчого комітету Сергій Сухомлин, народний депутат Геннадій Зубко.